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Bioinformática, el ADN a un solo clic

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    ComprarVendedor Libreria de la U
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    Este libro aborda el estudio de la Bioinformática centrándose, precisamente, en estos dos enfoques. En los primeros capítulos se estudian las características de la información biológica y qué principios es necesario tener en cuenta a la hora de diseñar un sistema  de información biológico. Po otro lado, es segunda parte, la obra se centra en  presentar herramientas y métodos de análisis de dicha información biológica. Es importante subrayar que se ha hecho especial hincapié en seleccionar herramientas de fuentes abiertas (open source), ya que de esta manera estarán a al alcance de cualquier lector, sin tener que depender de onerosos costes de licencias.

    Atributos LU

    TítuloBioinformática, el ADN a un solo clic
    AutorDavid Roldán Martínez
    CoeditorRa-Ma Editorial
    Tabla de Contenido
    Autor
    Prólogo 

    Capítulo 1
    Introducción

    1.1 A quién va destinado este libro
    1.2 Estructura de este libro
    1.3 Leyendas 

    Capítulo 2
    Fundamentos biológicos 


    2.1 Fisiología celular
    2.2 Morfología del cromosoma 

    2.3 Ácidos nucleicos 
    2.3.1 Adn
    2.3.2 Arn
    2.3.3 Código genético 

    2.4 Dogma central de la biología molecular 
    2.5 Regulación génica

    Capítulo 3
    Formatos de ficheros 


    3.1 Datosenbruto
    3.2 Fasta
    3.3 Fastaq
    3.4 Sam/bam
    3.5 Gff/gff3
    3.6 Gvf
    3.7 Vcf. 
    3.8 Bed 

    Capítulo 4
    Bases de datos genómicas 


    4.1 ¿Qué es una base de datos genómica? 
    4.2 Clasificación de las bases de datos genómicas 
    4.3 Características de la información genómica 
    4.4 Construcción de una base de datos genómica
    4.5 Modelado de información genómica 
    4.6 Integración de bases de datos biológicas 

    Capítulo 5
    Práctica 1: Diseño de bases de datos biológicas


    5.1 Diseño relacional  
    5.2 Diseño xml 

    Capítulo 6
    Principales bases de datos genómicas
     
    6.1 Genbank 
    6.1.1 Formato del registro  
    6.1.2 Cabecera  
    6.1.3 Sección de características 
    6.1.4 Sección Orgin
     
    6.2 Refseq
    6.3 Uniprot  

    6.4 Pdb  
    6.4.1 Formato del registro 
    6.4.2 Tipos de registros  
    6.4.3 Estructura del fichero 

    6.5 Otras bases de datos genómicas 
    6.5.2 Bases de datos de secuencias de ARN 
    6.5.3 Bases de datos de secuencias de proteínas  
    6.5.4 Bases de datos de patrones y perfiles  
    6.5.5 Bases de datos clínico-genéticas  
    6.5.6 Bases de datos de mutaciones y SNP 
    6.5.7 Bases de datos de genómica funcional

    Capítulo 7
    Prácnca2: búsqueda de secuencias 


    7.1 Secuencias de organismos procariotas 
    7.2 Secuencias de organismos eucariotas 
    7.3 Búsqueda de variaciones 
    7.4 Ejemplo de estudio de una proteína 

    Capítulo 8
    Análisis de secuencias 

    8.1 Detección de orf 
    8.2 Análisis de calidad 
    8.3 Alineamiento 

    8.3.1 Gráficos de puntos 
    8.3.2 Alineamiento de pares  
    8.3.3 Alineamiento múltiple  
    8.3.4 Puntuación del alineamiento 

    8.4 Identificación de variaciones
     
    8.5 Anotación 
    8.6 Visualización 
    8.7 Pipeline s analíticos y sistemas de flujo de trabajo 

    Capítulo 9
    Práctica 3: análisis de secuencias 


    9.1 Análisis de la calidad con vecscreen 
    9.2 Análisis de la composición del adn 
    9.2.1 Búsqueda de palabras 
    9.2.2 Estadísticas de la secuencia con genomatix 
    9.2.3 Búsqueda de repeticiones 
    9.2.4 Búsqueda de orf  

    9.3Alineamiento de secuencias con blastn 

    9.4 Edición de alineamientos 
    9.4.1 Creación de grupos 
    9.4.2 Reordenación del alineamiento 
    9.4.3 Adición y borrado de huecos 

    9.5 Búsqueda de secuencias homólogas con sib-blast 

    9.6 Alineamiento múltiple 
    9.6.1 Alineamiento múltiple con clustal omega 
    9.6.2 Alineamiento múltiple con muscle 
    9.6.3 Alineamiento múltiple con t-coffee 

    Capítulo 10
    Proteómica 


    10.1Generalidades  
    10.2Estructura de las proteínas  
    10.3 Métodos de predicción  
    10.4 Modelado por homología  
    10.5 Reconocimiento de pliegues  

    Capítulo 11
    Práctica 4: análisis de proteínas 

    11.1 Análisis blast 

    11.2 Búsqueda de dominios funcionales 
    11.2.1 Búsqueda de dominios con EBI-Interpro 
    11.2.2 Búsqueda de dominios con PF AM 

    11.3 Predicción de la ubicación subcelular 
    11.4 Búsqueda de estructuras de referencia 
    11.5 Búsqueda de motivos 

    11.6 Análisis de la estructura primaria de una proteína 
    11.6.1 Traducción del ADN en secuencia proteica
    11.6.2 Predicción de las propiedades físico-químicas 

    11.7 Predicción de la estructura secundaria
    11.8 Predicción de la estructura terciaria 
    11.9 Predicción de genes con genscan 

    Bibliografía 
    Índice alfabético 
    TipoLibro
    ISXN9789587624311
    Año de Edición2015
    Núm. Páginas262
    Peso (Físico)420
    Tamaño (Físico)17 x 24 cm
    Acabado (Físico)Rústica

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