Las pérdidas ocasionadas por insectos en los diferentes cultivos comerciales representan de un 10 a un 30% de los costos de producción, llegando a ser mayores en algunos cultivos y épocas del año. Los insecticidas químicos se han constituido en el principal método de control de plagas, lo cual ha originado serios problemas tales como la generación de resistencia de insectos a los plaguicidas, la eliminación de la fauna benéfica, la contaminación de los ecosistemas y la presencia de residuos tóxicos en los alimentos. El control biológico mediante el uso de microorganismos entomopatógenos representa una alternativa de menor impacto ecológico para el manejo de insectos de importancia económica en la agricultura. Colombia, como país tropical, posee una gran diversidad de insectos plaga y benéficos, así como de entomopatógenos que contribuyen a la regulación de las poblaciones insectiles. En el presente trabajo se estandarizaron metodologías para la caracterización microscópica, bioquímica, molecular y biológica de cepas nativas de B. thuringiensis; basadas en el estudio de la presencia, forma y cantidad de cristales y esporas y el análisis del perfil electroforético de proteínas totales de cultivos en fase estacionaria y de los productos de la amplificación de genes cry por medio de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR). Las metodologías estandarizadas se emplearon para la caracterización de 192 aislamientos del Banco de Cepas Nativas de B. thuringiensis de la UJTL. La información obtenida permitió clasificar y seleccionar las cepas del Banco de acuerdo a su actividad biológica potencial para el control de Tuta absoluta, insecto plaga del tomate y también reconocer la presencia de proteínas novedosas con actividad biológica desconocida en algunas de las cepas.En el presente trabajo se estandarizaron metodologías para la caracterización microscópica, bioquímica, molecular y biológica de cepas nativas de B. thuringiensis; basadas en el estudio de la presencia, forma y cantidad de cristales y esporas y el análisis del perfil electroforético de proteínas totales de cultivos en fase estacionaria y de los productos de la amplificación de genes cry por medio de la reacción en cadena de la polimerasa (PCR). Las metodologías estandarizadas se emplearon para la caracterización de 192 aislamientos del Banco de Cepas Nativas de B. thuringiensis de la UJTL. La información obtenida permitió clasificar y seleccionar las cepas del Banco de acuerdo a su actividad biológica potencial para el control de Tuta absoluta, insecto plaga del tomate y también reconocer la presencia de proteínas novedosas con actividad biológica desconocida en algunas de las cepas.