Introducción a Python

¿Qué es Python?CaracterísticasInstalación de PythonInstalación en WindowsInstalación en GNU/ LinuxPrimer programa con PythonTipos de datos básicosEstructuras de datosOperadoresEstructuras de control de flujoFuncionesMódulos y paquetesExcepciones Capítulo I
Introducción a Biopython

¿Qué es Biopython?¿Para quién es Biopython?RequerimientosInstalación de NumpyInstalación de Biopython Capítulo II
Trabajar con secuencias básicas

Trabajando con diferentes tipos de alfabetoOperaciones con el objeto SeqTraducciónComplemento y complemento reversoSecuencias mutablesSecuencias a Strings Capítulo III
Trabajar con secuencias con más información

¿Cuándo utilizar SeqRecord?Características y atributos de SeqRecordCrear un objeto SeqRecordCrear un objeto SeqRecord con característicasCreación de característicasImpresión en diferentes formatosCortar y operar objetos SeqRecord Capítulo IV
Crear secuencias desde archivos y texto

¿Cuándo utilizar Bio.Sequio?Leer desde archivos con solo una secuenciaLeer desde archivos con múltiples secuenciasLeer desde archivos comprimidos Capítulo V
Escribir secuencias a archivos Capítulo VI
Trabajar con alineamiento de secuencias

Biopython y ClustalWInstalación de ClustalWGeneración de un filogramaBiopython y MUSCLELectura desde archivos de múltiples alineamientosConversión entre formatos de alineamiento Capítulo VII
Ejecutar BLAS y leer sus resultados

Ejecutar BLAST en InternetEjecutar BLAST en LocalEjecuciónLeer desde la salida de BLAST Capítulo VIII
Conexión con bases de datos biológicas

EntrezEntrez y BiopythonBuscar registros relacionados Capítulo IX
Creación de árboles filogenéticos

Biopython y FilogeniaGenerar árboles en ASCIIGenerar árboles en imágenesEditar filogramaAlgunas funciones útiles de los árboles Capítulo X
Códigos de ejemplo

Código de ejemplo 1. Hallar el contenido de GCCódigo de ejemplo 2. Convertir entre diferentes formatosCódigo de ejemplo 3. “Voy a tener suerte” versiónEntrez con proteínasCódigo de ejemplo 4. Leer desde una salida de BLAST y guardar en una base de datos MySQLCódigo de ejemplo 5. Crear un árbol filogenético a partir de varios archivos de secuencias FastaFAQ

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